Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms