Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf50Q8WW18 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms