Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI0

OTOG, Otogelin, humanhuman

Predictions only

Length 2,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOGQ6ZRI0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTOGQ6ZRI0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms