Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HP1BP3Q5SSJ5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HP1BP3Q5SSJ5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HP1BP3Q5SSJ5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HP1BP3Q5SSJ5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HP1BP3Q5SSJ5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms