Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms