Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms