Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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TAF13Q15543 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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TAF13Q15543 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TAF13Q15543 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TAF13Q15543 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TAF13Q15543 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TAF13Q15543 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TAF13Q15543 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF13Q15543 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms