Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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