Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
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