Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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