Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms