Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSM1Q08AH1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms