Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms