Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms