Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms