Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAG2P55895 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAG2P55895 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms