Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms