Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms