Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRATP43155 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRATP43155 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRATP43155 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRATP43155 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRATP43155 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRATP43155 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRATP43155 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRATP43155 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRATP43155 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRATP43155 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRATP43155 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRATP43155 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRATP43155 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms