Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms