Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PVALBP20472 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PVALBP20472 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PVALBP20472 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PVALBP20472 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PVALBP20472 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PVALBP20472 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PVALBP20472 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PVALBP20472 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PVALBP20472 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms