Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms