Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC192P0DO97 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms