Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms