Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms