Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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VEGFDO43915 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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VEGFDO43915 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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VEGFDO43915 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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VEGFDO43915 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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VEGFDO43915 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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VEGFDO43915 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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VEGFDO43915 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFDO43915 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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