Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms