Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms