Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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