Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8B2A6NJW9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms