Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms