Protein–RNA interactions for Protein: A6NF89

OR6C6, Olfactory receptor 6C6, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR6C6A6NF89 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OR6C6A6NF89 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms