Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFT27Q9BW83 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT27Q9BW83 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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