Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms