Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms