Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms