Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL15Q96M94 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL15Q96M94 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL15Q96M94 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL15Q96M94 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL15Q96M94 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL15Q96M94 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL15Q96M94 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL15Q96M94 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL15Q96M94 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL15Q96M94 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms