Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CPNE2Q96FN4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms