Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF21BQ96EK2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms