Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms