Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4BQ92750 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms