Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATAD2BQ8WXI9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATAD2BQ8WXI9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms