Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms