Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NANOGNBQ7Z5D8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGNBQ7Z5D8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms