Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms