Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms