Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms