Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTBP1Q13363 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms