Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 HERPUD1-219ENST00000570273 1425 ntTSL 1 (best)17.75■□□□□ 0.436e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 DHPS-212ENST00000596847 646 ntTSL 517.28■□□□□ 0.362e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.326e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 KLC4-219ENST00000486439 756 ntTSL 216.63■□□□□ 0.252e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.232e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RETREG3-208ENST00000589797 4149 ntTSL 216.29■□□□□ 0.26e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.182e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 DHPS-205ENST00000593432 556 ntTSL 416.07■□□□□ 0.162e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 DHPS-209ENST00000595844 909 ntTSL 216.06■□□□□ 0.162e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 DHPS-203ENST00000593400 585 ntTSL 416.06■□□□□ 0.162e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 WDR76-204ENST00000478130 1172 ntTSL 315.82■□□□□ 0.122e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.026e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.012e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 DHPS-204ENST00000593423 540 ntTSL 414.72□□□□□ -0.052e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 CCS-202ENST00000525435 798 ntTSL 214.64□□□□□ -0.072e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.092e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.176e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 CLPP-204ENST00000596149 745 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.196e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.222e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.224e-6■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.67□□□□□ -0.222e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 DHPS-213ENST00000597152 605 ntTSL 513.46□□□□□ -0.252e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 DHPS-216ENST00000599481 476 ntTSL 313.25□□□□□ -0.292e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 KLC4-215ENST00000479388 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 MUC1-216ENST00000467134 619 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.416e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.442e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ILVBL-206ENST00000533086 4248 ntTSL 212.26□□□□□ -0.452e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 WDR76-202ENST00000381246 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.512e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 THOC2-207ENST00000438358 1137 ntTSL 511.1□□□□□ -0.632e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 LIN52-205ENST00000555028 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.692e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 KLC4-209ENST00000467906 3604 ntTSL 210.38□□□□□ -0.752e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 DHPS-215ENST00000598850 677 ntTSL 510.21□□□□□ -0.772e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 DHPS-211ENST00000596162 595 ntTSL 310.21□□□□□ -0.772e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 DHPS-217ENST00000600451 498 ntTSL 310.11□□□□□ -0.792e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.892e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 WDR76-201ENST00000263795 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.932e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 MUC1-205ENST00000368389 543 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -16e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 MUC1-206ENST00000368390 804 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -16e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -16e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 MUC1-210ENST00000368398 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -16e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 METTL9-207ENST00000567404 763 ntTSL 38.53□□□□□ -1.042e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 HERPUD1-208ENST00000563911 844 ntTSL 37.84□□□□□ -1.156e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 METTL9-204ENST00000562961 785 ntTSL 26.99□□□□□ -1.292e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 USP39-213ENST00000467885 338 ntTSL 56.84□□□□□ -1.312e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.382e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 TIMM9-201ENST00000216463 1075 ntTSL 36.44□□□□□ -1.382e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 HERPUD1-213ENST00000568358 751 ntTSL 55.69□□□□□ -1.56e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.522e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.542e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.652e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 METTL9-208ENST00000568826 376 ntTSL 34.72□□□□□ -1.652e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.692e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 THOC2-212ENST00000464161 660 ntTSL 24.46□□□□□ -1.72e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.012e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.641e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.042e-15■■■□□ 18
PABPC4Q13310 EMP3-201ENST00000270221 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-15■■■□□ 18
PABPC4Q13310 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.419e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.19e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.219e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.59e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RPS3-206ENST00000526248 771 ntTSL 519.12■□□□□ 0.652e-37■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-37■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RPS3-218ENST00000532872 737 ntTSL 315.6■□□□□ 0.092e-37■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RPS3-216ENST00000530721 796 ntTSL 315.6■□□□□ 0.092e-37■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.032e-37■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-37■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RPS3-202ENST00000422465 903 ntTSL 211.44□□□□□ -0.582e-37■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RPS3-210ENST00000528439 473 ntTSL 311.37□□□□□ -0.592e-37■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RPS3-219ENST00000534440 564 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.592e-37■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ZFAS1-207ENST00000458653 596 ntTSL 233.85■■■■□ 3.013e-9■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ZFAS1-202ENST00000371743 1008 ntTSL 1 (best)30.48■■■□□ 2.473e-9■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ZFAS1-203ENST00000417721 860 ntTSL 1 (best)29.57■■■□□ 2.323e-9■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ZFAS1-205ENST00000441722 946 ntTSL 1 (best)25.8■■□□□ 1.723e-9■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.723e-9■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ZFAS1-209ENST00000620594 508 ntTSL 39.45□□□□□ -0.93e-9■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ZFAS1-201ENST00000326677 504 ntTSL 1 (best)9.05□□□□□ -0.963e-9■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ZFAS1-204ENST00000428008 566 ntTSL 29.05□□□□□ -0.963e-9■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.361e-36■■■□□ 18
PABPC4Q13310 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.442e-6■■■□□ 18
PABPC4Q13310 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.272e-6■■■□□ 18
PABPC4Q13310 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.062e-6■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RPL18-216ENST00000552851 691 ntTSL 515.18■□□□□ 0.022e-46■■■□□ 18
PABPC4Q13310 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.1□□□□□ -1.274e-11■■■□□ 18
PABPC4Q13310 CCDC28B-204ENST00000469003 1235 ntTSL 220.19■□□□□ 0.825e-6■■■□□ 18
PABPC4Q13310 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.21e-10■■■□□ 18
PABPC4Q13310 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.121e-10■■■□□ 18
PABPC4Q13310 TRMT112-204ENST00000537918 559 ntTSL 1 (best)22.66■■□□□ 1.221e-9■■■□□ 18
PABPC4Q13310 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.131e-15■■■□□ 18
PABPC4Q13310 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.041e-15■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.634e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-233ENST00000636701 2158 ntTSL 518.78■□□□□ 0.64e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.54e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.374e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.354e-8■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.344e-8■■■□□ 18
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