Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3Q12983 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms